Подростковые проблемы кажутся не столь серьезными только тем, кто их уже оставил позади. А вот во время обучения в школе каждый вопрос стоит крайне остро. В центре истории «Беспокойное сердце» показана группа подростков из Японии, которые ведут вполне обыденную жизнь, учатся и развлекаются вместе и по отдельности. Главный герой по имени Такаюки Наруми ничем особо не выделяется среди одноклассников, но тесно общается с Синдзи Тайра, его лучшим другом, и двумя подругами - Харука Судзумия и Мицки Хаясе. Неразлучная четверка превосходно общается и со временем чувства трансформируются в более глубокую привязанность. Главному герою по секрету рассказывают, что Хараюки в него влюблена по уши, а вот Синдзи больше нравится Мицки. Но парочек из них не получается, поскольку Такаюки равномерно распределяет свое внимание между обеими девушками, которые и к нему питают нежные чувства. Никак он не может определиться, эта бесхарактерность становится причиной трагедии, после чего многие судьбы коренным образом меняются…