Анимационный фильм Манускрипт ниндзя (Ninja Scroll) перенесет вас в эпоху великих воинов. Однажды провинция Ямасиро удивила Японию непонятно откуда взявшейся эпидемией чумы. Жители покидают местность страдающую от напасти, а лидер одного самурайского клана отправляет в разведку своих бойцов из клана Кога. Однако, отряд разбивают сильные существа наделенные не человеческими силами. Выжить сумела лишь девушка по имени Кагэро, и то благодаря помощи Дзюбэя, который сумел ликвидировать одного из вражеских воинов. Однако, остальные члены отряда очень огорчены смертью своего напарника и теперь жаждут отомстить бродячему самураю.
