Сюжет приключенческого мультфильма «Шевели ластами 2» продолжает повествование о жизни и приключениях представителей морской фауны. Герой первой части мультфильма – черепаха по имени Сэмми и его друг Рэй, уже довольно старые черепахи, поведавшие на своем веку немало приключений. Однако теперь они ведут спокойную и размеренную жизнь, присматривая за недавно вылупившемся потомством. Однажды юный черепашонок Рикки становится свидетелем того, как дедушек похищают браконьеры. Заручившись поддержкой своей подруги Элли, они вместе отправляются на поиски любимых дедуль. Впереди их ждет далекое путешествие, с морем удивительных приключений.